Silent Scarf menceritakan kisah Ren Karibata, seorang administrator perdagangan berusia sembilan belas tahun di desa Riverbrick yang makmur. Hidup Ren hancur ketika Kerajaan Suragato tiba-tiba menyerang dan menghancurkan Riverbrick, yang mengakibatkan kedua orang tuanya terbunuh. Ibu Ren meninggalkan syal warna biru langit yang kemudian menjadi motivasi Ren untuk bertempur. Ren melarikan diri ke Brickvia, dan bergabung menjadi anggota militer. Pengalamannya sebagai korban perang menjadikannya bertekad untuk mengakhiri perang tanpa membunuh lawannya.